Päevaplaan
Kooliuksed avatakse kell 8 hommikul, kuid õppetöö algab kell 9. Iga päeva juhatab sisse hommikuring, mille käigus lepitakse kokku päevaplaan ja eesmärgid. Koolipäeva sees on kaks pikka 45 minuti pikkust vahetundi, millest vähemalt üks on aktiivne õuevahetund. Õppetöö lõpeb sõltuvalt tunniplaanist kell 13.35-15.15.
Pikapäevarühm
Pikapäevarühm toimub igal koolipäeval. Pikapäevarühma tasu on 7 eurot päevas või maksimaalselt 60 eurot kuus. Kui laps jääb rühma kauemaks kui 16.00, lisandub 1,8 eurot lisatoidu eest. Pikapäevarühm toimub vastavalt tunniplaanile kas 13.35-17.00 või 14.24 - 17.00.
Õhtuoode
1.-5. klassi õpilasel on võimalik Keevise majas õhtuoodet süüa kell 14.35-14.45. Ühe korra hind on 1,8 eurot. Õhtuoode aitab lapsel peale koolipäeva lõppu ja enne huviringidesse suundumist kõhu täis süüa. Õhtuootele saab registreeruda kalendrikuu kaupa. Õhtuoode pole automaatselt arvestatud pikapäevarühmas osalejatele. Soovi korral on vajalik teha registreerimine.
Huviringid
Pärast koolipäeva on võimalik osa võtta mitmest Emili huviringist. Huviringide valik ja ajagraafik avaldatakse iga õppeaasta alguses.
Juhtimine
Emili kooli juhib ja esindab direktor, järgides kooli pidaja ja kooli nõukogu seaduslikke korraldusi.Lisaks töötab kooli nõukogu, mille töö eesmärgiks on kooli juhtimise toetamine nõuandva organina kooli direktorile ja kooli pidajale. Nõukogu koguneb vähemalt kaks korda aastas.
Vähemalt neli korda aastas koguneb kooli õppenõukogu, mille ülesandeks on kooli õppe- ja kasvatustegevuse kindlaksmääramine, analüüsimine, hindamine ja juhtimiseks vajalike otsuste tegemine.